Μία ακόμα πτήση την ημέρα προσθέτει η Aegean Airlines από 5/3/2016. Συγκεκριμένα πέραν της πρωϊνής και της βραδινής πτήσης, που υπήρχαν τη χειμερινή περίοδο, προστίθεται και μία ακόμα πολύ πρωινή πτήση, που θα γίνεται με Airbus A320.
Έτσι το πρόγραμμα από 5/3 αλλάζει και περιλαμβάνει τις πτήσεις:
A3350, αναχώρηση από Αθήνα 05:30, άφιξη στη Σαντορίνη 06:15
A3352, αναχώρηση από Αθήνα 10:00, άφιξη στη Σαντορίνη 10:45
Α3360, αναχώρηση από Αθήνα 19:00, άφιξη στη Σαντορίνη 19:45
A3350, αναχώρηση από Σαντορίνη 06:45, άφιξη στην Αθήνα 07:30
A3352, αναχώρηση από Σαντορίνη 11:20, άφιξη στην Αθήνα 12:05
Α3360, αναχώρηση από Σαντορίνη 20:20, άφιξη στην Αθήνα 21:05
Να σημειώσουμε ότι από το Σάββατο 12/3/2016, πριν την Καθαρά Δευτέρα, οι πτήσεις γίνονται τέσσερις, με την προσθήκη μιας απογευματινής πτήσης, ενώ θα προστεθούν και άλλες πτήσεις καθώς θα πλησιάζει η υψηλή θερινή περίοδος.